Pusat Sukan UMS diterajui oleh seorang Pengarah dan dibantu oleh pegawai-pegawai sukan serta kakitangan pentadbiran. Struktur organisasi Pusat Sukan UMS terdiri daripada Pejabat Pengarah, Unit Pengurusan Fasiliti, Unit Pembangunan Atlet, dan Unit Pentadbiran dan Kewangan.